Las Pingüineras de Chiloé o de Puñihuil se encuentran en el sector del mismo nombre, en la costa oeste frente al océano pacífico en la comuna de Ancud, archipiélago de Chiloé, Las pinguineras de Puñihuil se encuentran a 28 kilómetros al suroeste de Ancud, en la X Región de Los Lagos.